Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMD5Q16401 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD5Q16401 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD5Q16401 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD5Q16401 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD5Q16401 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMD5Q16401 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms