Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SF1Q15637 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SF1Q15637 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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