Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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TAF1AQ15573 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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