Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms