Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PDE6HQ13956 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PDE6HQ13956 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PDE6HQ13956 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PDE6HQ13956 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PDE6HQ13956 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PDE6HQ13956 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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PDE6HQ13956 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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PDE6HQ13956 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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