Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
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SHROOM2Q13796 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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SHROOM2Q13796 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
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SHROOM2Q13796 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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SHROOM2Q13796 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
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SHROOM2Q13796 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHROOM2Q13796 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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