Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOFQ13790 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOFQ13790 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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APOFQ13790 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOFQ13790 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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