Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDH18Q13634 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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