Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF1Q13351 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
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