Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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