Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms