Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSPB3Q12988 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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