Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms