Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CNTN1Q12860 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTN1Q12860 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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