Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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STX4Q12846 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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STX4Q12846 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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STX4Q12846 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
STX4Q12846 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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STX4Q12846 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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STX4Q12846 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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STX4Q12846 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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