Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBRQ0VD83 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms