Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY1Q0D2K3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms