Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK1Q08629 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms