Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms