Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC9Q06265 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms