Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OCA2Q04671 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms