Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms