Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORDQ00796 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORDQ00796 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORDQ00796 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORDQ00796 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORDQ00796 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORDQ00796 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORDQ00796 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORDQ00796 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORDQ00796 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORDQ00796 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SORDQ00796 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SORDQ00796 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SORDQ00796 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORDQ00796 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORDQ00796 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORDQ00796 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORDQ00796 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORDQ00796 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SORDQ00796 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORDQ00796 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms