Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAMQ00059 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms