Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFI35P80217 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI35P80217 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI35P80217 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI35P80217 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI35P80217 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI35P80217 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI35P80217 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI35P80217 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI35P80217 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI35P80217 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI35P80217 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI35P80217 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms