Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2MP61081 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2MP61081 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2MP61081 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms