Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms