Protein–RNA interactions for Protein: P48736

PIK3CG, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CGP48736 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CGP48736 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CGP48736 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms