Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms