Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARL4AP40617 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms