Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLT4P35916 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FLT4P35916 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FLT4P35916 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FLT4P35916 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLT4P35916 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FLT4P35916 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLT4P35916 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FLT4P35916 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FLT4P35916 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FLT4P35916 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLT4P35916 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FLT4P35916 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms