Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms