Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DMAP28067 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms