Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms