Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRT10P13645 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRT10P13645 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KRT10P13645 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KRT10P13645 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KRT10P13645 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT10P13645 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT10P13645 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT10P13645 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT10P13645 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT10P13645 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KRT10P13645 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms