Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL2P13500 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL2P13500 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL2P13500 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms