Protein–RNA interactions for Protein: P07202

TPO, Thyroid peroxidase, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPOP07202 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPOP07202 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPOP07202 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms