Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-HP01893 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms