Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTSVO60911 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTSVO60911 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSVO60911 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSVO60911 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSVO60911 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSVO60911 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSVO60911 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSVO60911 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSVO60911 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSVO60911 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTSVO60911 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms