Protein–RNA interactions for Protein: O60739

EIF1B, Eukaryotic translation initiation factor 1b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF1BO60739 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EIF1BO60739 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms