Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PDE6DO43924 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6DO43924 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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