Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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