Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD1B0YJ81 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms