Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf49A4QMS7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms