Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMB4A4D0S4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMB4A4D0S4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms