Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms