Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM35Q9UPQ4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM35Q9UPQ4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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