Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MED23Q9ULK4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED23Q9ULK4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms