Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms