Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX1-2Q9UD57 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX1-2Q9UD57 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms